频谱剖析仪一般只要一个射频输入端，这不同于示波器多通道输入，可以用来比较通道之间的波形差异。频谱剖析仪遍及根据扫描的动态丈量进程，显现的谱线并不是实时的，尽管许多频谱剖析仪供给了外部触发或视频触发的功用，但更多是一种同步功用，首要并不是用来触发比较的。
频谱剖析仪射频输入端的输入阻抗一般为50Ω或75Ω，然后可以直接与大多数射频和微波设备的50Ω体系相匹配，并经过线缆直连，一般是没有探头的，因为探头需求很高的输入阻抗，例如电路的勘探往往需求高阻抗，而50Ω难以带动这类负载，使得丈量成果严峻变小。有一些高输入阻抗放大器具有50Ω输出阻抗，这种放大器构成的有源探头有助于完成这类丈量并保持高灵敏度。在有些频谱剖析仪的射频输入端的周围，常会供给有源探头的供电口（probe power）。
射频输入前端内部结构
一般频谱剖析仪的丈量规模不是从直流开端，低频测验的约束是射频输进口的耦合结构。大部分频谱剖析仪应用了积分耦合电容来维护混频器，防止外部灌入直流能量，这个电容抬升了低端丈量的频率，大部分频谱剖析仪的开端丈量频率仅能从9kHz开端。
许多特别是有极低频率的频谱剖析仪选用的是直流耦合，即在射频输入与榜首混频器之间没有耦合%&&&&&%。在有的场合中，直流电和射频信号传输选用同一根电缆，这样直流可能会损坏混频器，必定要注意频谱剖析仪的维护电流。丈量这样的射频信号时，要外加隔直流维护器，所引起的功率衰减应被考虑肯定电平丈量成果中。当然对输入信号电平也要进行正确预算，防止频谱剖析仪射频输入大于频谱剖析仪答应的安全电平，一般频谱剖析仪射频输进口处都会主动保存10dB衰减，除非手动设置为0dB，这样做尽管抬高了底噪，可是维护了混频器，一起改进了输入端口的匹配。
输入端口一般选用N头或SMA头，线缆选用同轴电缆。射频衔接器和线缆品种繁复，具有不同的结构和技术指标，价格差异也十分巨大，运用时要根据带宽、频响、VSWR、衰减、屏蔽性以及柔软度来挑选相应的质量。
在精细丈量体系中，因为频谱剖析仪自身以射频输进口为校准参阅面，假如增加了线缆和衔接器会引进额定的差错，常需求首要进行线损的校准，将衔接器和线缆的呼应成果提早计算出来，并将成果保存在仪器内部或在后期剖析中折算到成果里，使校准参阅面可以包括线缆和衔接器，移到真实的丈量端口，使丈量成果只包括被测器材自身。
在某些情况下，频谱剖析仪自身的丈量规模无法满意实践需求，一般要预先衔接外部放大器或衰减器，这样的丈量进程中，放大器或许衰减器自身的值也要补偿到成果中。一般频谱剖析仪会供给“参阅偏移”选项，用来补偿成果的偏移。若放大器、线缆或天线等的频率呼应有动摇，就不能独自运用“参阅偏移”的补偿方法，而是要运用批改（Correction）功用，将线缆或天线的频响预先储存在频谱剖析仪内部，这样频响的影响就可以直接反映到丈量成果中。
