透明代理与透明模式都可以简化防火墙的设置，提高系统安全性。但两者之间也有本质的区别:工作于透明模式的防火墙使用了透明代理的技术，但透明代理并不是透明模式的全部，防火墙在非透明模式中也可以使用透明代理。